Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sfxn3Q91V61 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfxn3Q91V61 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfxn3Q91V61 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms