Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRSF12Q8WXF0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms