Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN2

Atp1a1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a1Q8VDN2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a1Q8VDN2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a1Q8VDN2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms