Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpap2Q8VC34 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpap2Q8VC34 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap2Q8VC34 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms