Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCOLN3Q8TDD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms