Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3IL1Q8TBN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3IL1Q8TBN0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms