Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk8Q8R3L8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk8Q8R3L8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk8Q8R3L8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk8Q8R3L8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk8Q8R3L8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk8Q8R3L8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms