Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shtn1Q8K2Q9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shtn1Q8K2Q9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shtn1Q8K2Q9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Shtn1Q8K2Q9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shtn1Q8K2Q9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Shtn1Q8K2Q9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms