Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q7

Brox, BRO1 domain-containing protein BROX, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BroxQ8K2Q7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BroxQ8K2Q7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BroxQ8K2Q7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BroxQ8K2Q7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms