Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrit1Q8K099 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrit1Q8K099 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrit1Q8K099 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms