Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh2d5Q8JZW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms