Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFNL3Q8IZI9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNL3Q8IZI9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL3Q8IZI9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNL3Q8IZI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms