Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HACE1Q8IYU2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms