Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPA2Q8IWL1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPA2Q8IWL1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms