Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC83Q8IWF9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms