Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lancl3Q8CD19 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl3Q8CD19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms