Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacnb2Q8CC27 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacnb2Q8CC27 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacnb2Q8CC27 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms