Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc159Q8C963 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc159Q8C963 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms