Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek11Q8C0Q4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek11Q8C0Q4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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