Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc30Q8BVF4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc30Q8BVF4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc30Q8BVF4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms