Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcl3Q8BVF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcl3Q8BVF2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms