Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330017A01RikQ8BU47 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms