Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik4Q8BMF5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik4Q8BMF5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik4Q8BMF5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms