Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Chtf18Q8BIW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chtf18Q8BIW9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chtf18Q8BIW9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms