Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FERMT3Q86UX7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FERMT3Q86UX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FERMT3Q86UX7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms