Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc155Q80VJ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms