Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDXQ7Z353 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDXQ7Z353 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms