Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcph1Q7TT79 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mcph1Q7TT79 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcph1Q7TT79 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms