Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CdsnQ7TPC1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CdsnQ7TPC1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CdsnQ7TPC1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms