Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmc8Q7TN58 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmc8Q7TN58 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms