Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HhipQ7TN16 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HhipQ7TN16 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HhipQ7TN16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms