Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rph3alQ768S4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rph3alQ768S4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms