Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih3Q6ZWS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih3Q6ZWS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih3Q6ZWS4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnih3Q6ZWS4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnih3Q6ZWS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms