Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNC2Q6ZN30 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNC2Q6ZN30 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNC2Q6ZN30 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms