Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms