Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ptx4Q6RUU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ptx4Q6RUU0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptx4Q6RUU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms