Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neil2Q6R2P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neil2Q6R2P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms