Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AtminQ6P9S1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AtminQ6P9S1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AtminQ6P9S1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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