Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtl3Q6P1Y1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms