Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gpbp1Q6NXH3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpbp1Q6NXH3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpbp1Q6NXH3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms