Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bfsp2Q6NVD9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bfsp2Q6NVD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bfsp2Q6NVD9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms