Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retreg2Q6NS82 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg2Q6NS82 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms