Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggnbp1Q6K1E7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggnbp1Q6K1E7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms