Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ScapQ6GQT6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ScapQ6GQT6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms