Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rftn1Q6A0D4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rftn1Q6A0D4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms