Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg9aQ68FE2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg9aQ68FE2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg9aQ68FE2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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