Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgefl1Q68EF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgefl1Q68EF8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgefl1Q68EF8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgefl1Q68EF8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgefl1Q68EF8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgefl1Q68EF8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgefl1Q68EF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rapgefl1Q68EF8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rapgefl1Q68EF8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms