Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4eQ66X19 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4eQ66X19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms