Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Knl1Q66JQ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Knl1Q66JQ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Knl1Q66JQ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Knl1Q66JQ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms