Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VclQ64727 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VclQ64727 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VclQ64727 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VclQ64727 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VclQ64727 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VclQ64727 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VclQ64727 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VclQ64727 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VclQ64727 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VclQ64727 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VclQ64727 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VclQ64727 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VclQ64727 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VclQ64727 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VclQ64727 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VclQ64727 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VclQ64727 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VclQ64727 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VclQ64727 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VclQ64727 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VclQ64727 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VclQ64727 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VclQ64727 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VclQ64727 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VclQ64727 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VclQ64727 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VclQ64727 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VclQ64727 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VclQ64727 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VclQ64727 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VclQ64727 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VclQ64727 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VclQ64727 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms